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Les norovirus appartiennent à la famille des caliciviridae. Il s'agit d'un groupe de virus d'ARN non brillants non enveloppés, à sensations positifs qui provoquent principalement une gastro-entérite aiguë ou une inflammation gastro-intestinale. Le norovirus est caractérisé par une mutation rapide, une forte résistance environnementale et une faible dose infectieuse. Il est extrêmement adaptable à l'environnement et peut survivre dans une variété d'environnements, offrant des conditions favorables pour sa propagation. Le virus est principalement transmis par la route fécale-orale, la transmission des aérosols et le contact. Les symptômes de l'infection au norovirus apparaissent généralement dans les 12 à 48 heures après l'exposition et comprennent des nausées, des vomissements, des douleurs abdominales, de la fièvre, des maux de tête et de la diarrhée.
Utilisation prévue
Ce kit est conçu pour la détection des acides nucléiques du norovirus gi et du norovirus gii. Les résultats peuvent être utilisés comme aide au diagnostic de patients infectés par norovirus ou infection suspectée, et peuvent également être utilisés pour détecter les acides nucléiques de norovirus dans l'environnement et les aliments.
Les résultats de ce kit sont pour la référence diagnostique uniquement et ne doivent pas être utilisés comme seul critère de diagnostic. Il est recommandé d'analyser la condition en conjonction avec les manifestations cliniques du patient et d'autres résultats de tests de laboratoire.
Caractéristiques du produit
Les méthodes de détection du norovirus comprennent la microscopie électronique, les méthodes immunologiques et les méthodes moléculaires. Les méthodes moléculaires comprennent RT-qPCR, RT-lamp, la puce de gène, etc. Parmi eux, RT-QPCR est connu comme l'étalon-or pour détecter le norovirus mais a des inconvénients tels que la nécessité d'utiliser une courbe standard pour la quantification et la réaction affectée par les inhibiteurs. La PCR numérique a effectivement résolu ce problème. Le processus de détection ne nécessite pas de courbe standard et peut effectuer une analyse quantitative absolue de la charge du virus sans s'appuyer sur la valeur CT. De plus, le système de réaction nanolitre unique de PCR numérique peut réduire l'impact des inhibiteurs de la PCR et est compatible avec des volumes de chargement d'échantillons plus grands. Le test multi-plex améliore également l'efficacité de détection.
Les avantages de la méthode de PCR numérique dans la détection du norovirus sont les suivants:
Haute précision: le kit FastPlex ™ peut fournir une quantification absolue de l'acide nucléique cible sans avoir besoin d'une courbe standard. Il peut déterminer avec précision le numéro de copie du norovirus, ce qui est particulièrement utile pour la détection d'échantillons à faible abondance.
Résistance élevée aux inhibiteurs: le système de réaction nanolitre unique de la PCR numérique peut réduire l'impact des inhibiteurs de la PCR. Ceci est important pour la détection d'échantillons avec des matrices complexes, telles que les échantillons environnementaux et d'aliments, où des inhibiteurs peuvent être présents.
Sensibilité élevée : le kit FastPlex ™ peut détecter un petit nombre de molécules cibles dans un grand fond de molécules non cibles. Cela permet de détecter le norovirus dans des échantillons à faible charge virale.
Reproductibilité élevée : les résultats du test sont moins affectés par les conditions et les opérateurs expérimentaux et ont une bonne reproductibilité. Ceci est important pour la cohérence et la fiabilité des résultats de détection.
Détection de plusieurs génotypes dans un seul échantillon: le kit Fastplex ™ peut détecter simultanément le norovirus gi et / ou le norovirus gii. La sonde de détection pour le norovirus gi est marquée avec une fluorescence hexadécimale, la sonde de détection pour le norovirus gii est marquée avec une fluorescence FAM.
Ø Dosage de transcription inverse d'une étape.
Ø Il peut détecter diverses cibles telles que les excréments, les eaux usées, la nourriture, les patients et les patients suspects.
Ø Un seul puits peut différencier simultanément différents génotypes (norovirus gi, norovirus gii, phage de contrôle MS2 et contrôle interne humain).
Ø La quantification absolue du virus peut être aussi faible qu'une seule copie.
Le kit de détection de norovirus en une étape de la pluviation a un contrôle de qualité strict
(Canal Rox pour surveiller l'efficacité d'extraction)
Fam (Gⅱ) | Hexagonal (Gⅰ) | Rox (MS2) | CY5 ( Référence interne Humna ) | |
Contro positif | - | - | - | - |
Contrôle négatif | + | + | + | + |
L'analyse des résultats des tests est simple.
Non. | Fam ( Gⅱ) | Hexagonal (Gⅰ) | Rox (Contrôle d'extraction) | CY5 (Référence interne humaine) | Résultats |
1 | - | - | + | - | Négatif |
2 | + | - | +/- | +/- | Gii positif |
3 | - | + | +/- | +/- | Gi positiv |
4 | + | + | +/- | +/- | Gi et giipositif |
Les excellentes performances de linéarité du kit de détection de PCR numérique en une étape FastPlex ™ Norovirus
Plot 2D d'un échantillon de concentration dilué à 1 fois
Plot 2D d'un échantillon de concentration dilué à 10 fois
Plot 2D d' un échantillon de concentration dilué à 100 fois
Plot 2D d'un échantillon de concentration dilué à 1000 fois
La linéarité du norovirus GII dans une série d'échantillons dilués
La linéarité du norovirus GI dans une série d'échantillons dilués
Échantillon 1: gii positif
Sample5: GII & GI Positif
Sample4 : GI positif
Échantillon 18: GII positif
Coparation de la méthode DPCR et QPCR
Résultat du DPCR | Résultat qpcr | Résultat du DPCR | Résultat qpcr | ||||||
Samplenname | Hex (GI) | FAM (GII) | Phénotype | Valeur CT | Samplenname | Hex (GI) | FAM (GII) | Phénotype | Valeur CT |
Nov_1 | 0 | 6.14 | Gⅱ | 28.84 | Nov_32 | 1.86 | 0 | Gⅰ | 21 |
Nov_2 | 0 | 3.48 | Gⅱ | 22.58 | Nov_33 | 17397 | 0 | Gⅰ | 18.7 |
Nov_3 | 0 | 0.34 | Gⅱ | 25.19 | Nov_34 | 861 | 0 | Gⅰ | 23.3 |
Nov_4 | 18145 | 0 | Gⅰ | 30.86 | Nov_35 | 224 | 0 | Gⅰ | 25 |
Nov_5 | 28.7 | 24.6 | Gⅰ / gⅱ | 24,33 ; 22,83 | Nov_36 | 14.3 | 0 | Gⅰ | 22 |
Nov_6 | 247 | 0 | Gⅰ | 21.25 | Nov_37 | 12.8 | 0 | Gⅰ | 24 |
Nov_16 | 0 | 253 | Gⅱ | 16.07 | Nov_38 | 21.3 | 0 | Gⅰ | 25 |
Nov_18 | 0 | 0.207 | Gⅱ | 16.73 | Nov_39 | 0 | 439 | Gⅱ | 22.64 |
Nov_20 | 0 | 2.26 | Gⅱ | 30.19 | Nov_40 | 0 | 179 | Gⅱ | 23.91 |
Nov_21 | 0 | 4.54 | Gⅱ | 17.43 | Nov_42 | 0 | 582 | Gⅱ | 22.24 |
Nov_22 | 0 | 6.62 | Gⅱ | 30.13 | Nov_43 | 0 | 35.4 | Gⅱ | 24 |
Nov_23 | 1000000 | 859 | Gⅰ / gⅱ | 19,55 ; 23,54 | Nov_44 | 0 | 1467 | Gⅱ | 25 |
Nov_24 | 0 | 1000000 | Gⅱ | 19.89 | Nov_45 | 0 | 1.92 | Gⅱ | 22.6 |
Nov_25 | 0 | 127 | Gⅱ | 22.42 | Nov_46 | 0 | 34.8 | Gⅱ | 24.5 |
Nov_26 | 0 | 66.4 | Gⅱ | 22.99 | Nov_47 | 0 | 541 | Gⅱ | 21.6 |
Nov_27 | 0 | 0.872 | Gⅱ | 26.37 | Nov_48 | 0 | 179 | Gⅱ | 24 |
Nov_28 | 81.3 | 243 | Gⅰ / gⅱ | 26,34 ; 23,82 | Nov_49 | 0 | 443 | Gⅱ | 22 |
Nov_30 | 0.288 | 2.3 | Gⅰ / gⅱ | 25,92 ; 24,22 | Nov_50 | 0 | 8599 | Gⅱ | 20 |
Nov_31 | 146 | 0 | Gⅰ | 24.7 |