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PCR numérique de gouttelettes (ddPCR)

La réaction en chaîne par polymérase numérique (dPCR) est un raffinement biotechnologique des méthodes conventionnelles de réaction en chaîne par polymérase qui peut être utilisée pour quantifier directement et amplifier par clonage des brins d'acides nucléiques, y compris l'ADN, l'ADNc ou l'ARN.La principale différence entre la dPCR et la PCR traditionnelle réside dans la méthode de mesure des quantités d'acides nucléiques, la première étant une méthode plus précise que la PCR.Comme la PCR, dans la dPCR, une seule réaction est également effectuée dans un échantillon, mais l'échantillon est divisé en plusieurs partitions, la réaction étant effectuée dans chaque partition séparément.Avec cette division, les quantités d'acide nucléique peuvent être collectées et mesurées avec plus de précision et de sensibilité.La technique est régulièrement utilisée pour l'amplification clonale de matériaux pour le séquençage de nouvelle génération et s'est révélée bénéfique pour l'analyse des changements dans les séquences de gènes, y compris les variantes du nombre de copies et les mutations ponctuelles.Droplet Digital PCR (ddPCR) est une technique de dPCR dans laquelle une réaction d'échantillon de 20 microlitres est divisée en gouttelettes d'huile de 20 000 nanolitres à l'aide d'une technique d'émulsion eau-huile, thermocyclées dans une cartouche microfluidique, et l'amplitude de fluorescence de chaque gouttelette dans chaque puits d'échantillon est lu à l'aide d'un scanner de gouttelettes.
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Applications de la PCR numérique de gouttelettes

Diagnostic clinique

· Détection qualitative/quantitative de micro-organismes pathogènes infectieux (en particulier les micro-organismes à faible nombre de copies), détection de mutations dans le gène de résistance aux agents pathogènes, typage et identification des agents pathogènes.
· Variation génique liée à la tumeur/au cancer (mutation, fusion, méthylation, CNV, etc.) pour le dépistage précoce du cancer, le diagnostic compagnon, la pharmacothérapie ciblée, l'orientation thérapeutique, le suivi et l'évaluation de l'efficacité du traitement.
· Dépistage prénatal non invasif, détection des maladies génétiques néonatales telles que l'hypothyroïdie congénitale et la phénylcétonurie.

Surveillance environnementale

· Détection de micro-organismes complexes et peu abondants dans l'eau, le sol, le gaz et d'autres composants.
· Détection de micro-organismes pathogènes infectieux résistants aux médicaments dans les services, les laboratoires, les hôpitaux et d'autres surfaces environnementales.

La sécurité alimentaire

· Détection de micro-organismes pathogènes/non pathogènes dans les aliments tels que les produits laitiers.
· Échantillonnage et inspection des aliments, tels que la falsification de la viande et les ingrédients alimentaires génétiquement modifiés.

Produits biopharmaceutiques/ thérapie génique

· Évaluation de l'efficacité de l'édition de gènes.
· Évaluation de la sécurité biologique des vaccins et des anticorps pour les résidus de substances dérivées de l'hôte.
· Évaluation de l'efficacité des médicaments.

Sciences médico-légales

· Identification des espèces et quantification des échantillons.
· Analyse des marqueurs génétiques pour
identification.
· Analyse des traces de preuves et inférence de l'heure du décès.

Agriculture

· Identification des espèces génétiquement modifiées.
· Analyse des gènes de résistance au stress.
· Recherche sur les différences génétiques entre les espèces.
· Amélioration des plantes.
· Détection/identification de la source des maladies, telles que l'identification des parasites et des micro-organismes pathogènes.

Préparation des matériaux standards

· Quantification et contrôle qualité des matériaux de référence.
 
 
 
 
 
 

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